من أجل خدمة مصالح الدين الإسلامي والمحافظة على وحدته، وصد التيارات الفكرية والعقدية المتطرفة تم إحداث "مؤسسة محمد السادس للعلماء الأفارقة"، بموجب ظهير شريف صدر بالجريدة الرسمية عدد 6372، بتاريخ24 يونيو2015 ونص الظهير المذكورالذي يعتبر بمثابة النظام الأساسي لهذه المؤسسة الجديدة على أن هذه الأخيرة تهدف إلى توحيد وجمع جهود كل من علماء المغرب،وعلماء القارة الأفريقية في مجال تشجيع الأبحاث المرتبطة بالفكر والثقافة الإسلامية والتعريف بقيمها البعيدة عن التعصب والتطرف، هذا وتتوفر هذه المؤسسة ذات المنفعة العامة والتي سيكون مقرها بالرباط مع إمكانية خلق فروع لها بالقارة الأفريقية على أجهزة ثلاث مكونة من مجلس أعلى ومكتب تنفيذي، ورئاسته منتدبة.